Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mc1rQ01727 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mc1rQ01727 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms