Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sec23aQ01405 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec23aQ01405 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms