Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EgfrQ01279 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EgfrQ01279 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EgfrQ01279 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EgfrQ01279 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EgfrQ01279 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EgfrQ01279 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
EgfrQ01279 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
EgfrQ01279 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EgfrQ01279 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EgfrQ01279 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms