Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PrcdQ00LT2 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms