Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GabpaQ00422 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms