Protein–RNA interactions for Protein: P99026

Psmb4, Proteasome subunit beta type-4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb4P99026 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmb4P99026 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms