Protein–RNA interactions for Protein: P97801

Smn1, Survival motor neuron protein, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smn1P97801 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smn1P97801 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smn1P97801 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smn1P97801 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smn1P97801 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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