Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AlkP97793 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AlkP97793 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AlkP97793 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
AlkP97793 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AlkP97793 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AlkP97793 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AlkP97793 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AlkP97793 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AlkP97793 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AlkP97793 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AlkP97793 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AlkP97793 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AlkP97793 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AlkP97793 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AlkP97793 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AlkP97793 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AlkP97793 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
AlkP97793 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AlkP97793 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AlkP97793 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AlkP97793 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AlkP97793 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AlkP97793 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AlkP97793 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AlkP97793 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AlkP97793 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AlkP97793 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AlkP97793 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AlkP97793 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AlkP97793 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AlkP97793 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
AlkP97793 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
AlkP97793 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AlkP97793 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
AlkP97793 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AlkP97793 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AlkP97793 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AlkP97793 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AlkP97793 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AlkP97793 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
AlkP97793 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AlkP97793 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AlkP97793 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AlkP97793 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AlkP97793 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AlkP97793 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AlkP97793 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
AlkP97793 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
AlkP97793 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
AlkP97793 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
AlkP97793 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
AlkP97793 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AlkP97793 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AlkP97793 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
AlkP97793 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AlkP97793 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
AlkP97793 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AlkP97793 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AlkP97793 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
AlkP97793 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AlkP97793 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AlkP97793 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AlkP97793 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AlkP97793 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AlkP97793 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AlkP97793 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AlkP97793 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AlkP97793 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AlkP97793 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AlkP97793 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AlkP97793 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
AlkP97793 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AlkP97793 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AlkP97793 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AlkP97793 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AlkP97793 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AlkP97793 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AlkP97793 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AlkP97793 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AlkP97793 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AlkP97793 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AlkP97793 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AlkP97793 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AlkP97793 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AlkP97793 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AlkP97793 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
AlkP97793 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AlkP97793 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AlkP97793 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AlkP97793 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AlkP97793 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AlkP97793 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
AlkP97793 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AlkP97793 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AlkP97793 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AlkP97793 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AlkP97793 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AlkP97793 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AlkP97793 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms