Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pitx2P97474 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms