Protein–RNA interactions for Protein: P97460

Npas2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas2P97460 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Npas2P97460 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Npas2P97460 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Npas2P97460 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Npas2P97460 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Npas2P97460 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Npas2P97460 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Npas2P97460 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Npas2P97460 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Npas2P97460 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Npas2P97460 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Npas2P97460 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Npas2P97460 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Npas2P97460 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Npas2P97460 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Npas2P97460 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Npas2P97460 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Npas2P97460 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Npas2P97460 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Npas2P97460 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Npas2P97460 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Npas2P97460 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Npas2P97460 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Npas2P97460 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Npas2P97460 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Npas2P97460 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Npas2P97460 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Npas2P97460 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Npas2P97460 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Npas2P97460 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Npas2P97460 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Npas2P97460 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Npas2P97460 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Npas2P97460 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Npas2P97460 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Npas2P97460 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Npas2P97460 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Npas2P97460 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Npas2P97460 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Npas2P97460 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Npas2P97460 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Npas2P97460 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Npas2P97460 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Npas2P97460 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Npas2P97460 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Npas2P97460 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Npas2P97460 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Npas2P97460 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Npas2P97460 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Npas2P97460 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Npas2P97460 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Npas2P97460 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Npas2P97460 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Npas2P97460 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Npas2P97460 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Npas2P97460 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Npas2P97460 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Npas2P97460 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Npas2P97460 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Npas2P97460 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Npas2P97460 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Npas2P97460 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Npas2P97460 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Npas2P97460 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Npas2P97460 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Npas2P97460 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Npas2P97460 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Npas2P97460 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Npas2P97460 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Npas2P97460 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Npas2P97460 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Npas2P97460 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Npas2P97460 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Npas2P97460 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Npas2P97460 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Npas2P97460 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Npas2P97460 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Npas2P97460 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Npas2P97460 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Npas2P97460 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Npas2P97460 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Npas2P97460 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Npas2P97460 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Npas2P97460 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Npas2P97460 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Npas2P97460 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Npas2P97460 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Npas2P97460 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Npas2P97460 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Npas2P97460 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Npas2P97460 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Npas2P97460 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Npas2P97460 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Npas2P97460 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Npas2P97460 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Npas2P97460 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Npas2P97460 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Npas2P97460 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Npas2P97460 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Npas2P97460 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms