Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bop1P97452 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Bop1P97452 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bop1P97452 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bop1P97452 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Bop1P97452 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bop1P97452 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bop1P97452 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bop1P97452 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bop1P97452 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms