Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nbr1P97432 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nbr1P97432 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms