Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lig3P97386 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lig3P97386 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lig3P97386 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lig3P97386 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lig3P97386 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lig3P97386 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lig3P97386 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lig3P97386 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lig3P97386 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lig3P97386 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lig3P97386 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lig3P97386 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lig3P97386 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms