Protein–RNA interactions for Protein: P97369

Ncf4, Neutrophil cytosol factor 4, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncf4P97369 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ncf4P97369 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ncf4P97369 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ncf4P97369 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ncf4P97369 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ncf4P97369 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ncf4P97369 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ncf4P97369 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ncf4P97369 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ncf4P97369 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ncf4P97369 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ncf4P97369 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ncf4P97369 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ncf4P97369 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ncf4P97369 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ncf4P97369 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ncf4P97369 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ncf4P97369 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ncf4P97369 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ncf4P97369 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ncf4P97369 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ncf4P97369 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ncf4P97369 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ncf4P97369 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ncf4P97369 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ncf4P97369 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ncf4P97369 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ncf4P97369 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ncf4P97369 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ncf4P97369 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ncf4P97369 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ncf4P97369 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ncf4P97369 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ncf4P97369 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ncf4P97369 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ncf4P97369 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ncf4P97369 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
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Ncf4P97369 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ncf4P97369 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ncf4P97369 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ncf4P97369 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ncf4P97369 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Ncf4P97369 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ncf4P97369 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ncf4P97369 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ncf4P97369 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ncf4P97369 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ncf4P97369 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ncf4P97369 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ncf4P97369 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ncf4P97369 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ncf4P97369 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Ncf4P97369 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ncf4P97369 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ncf4P97369 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ncf4P97369 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ncf4P97369 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ncf4P97369 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ncf4P97369 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ncf4P97369 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ncf4P97369 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ncf4P97369 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ncf4P97369 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ncf4P97369 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ncf4P97369 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ncf4P97369 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ncf4P97369 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ncf4P97369 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ncf4P97369 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ncf4P97369 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ncf4P97369 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ncf4P97369 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ncf4P97369 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ncf4P97369 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ncf4P97369 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ncf4P97369 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ncf4P97369 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ncf4P97369 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ncf4P97369 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ncf4P97369 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ncf4P97369 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ncf4P97369 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ncf4P97369 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ncf4P97369 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms