Protein–RNA interactions for Protein: P86448

Trim43b, Tripartite motif-containing protein 43B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43bP86448 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim43bP86448 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms