Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Cbx1P83917 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Cbx1P83917 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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