Protein–RNA interactions for Protein: P82348

Sgcg, Gamma-sarcoglycan, mousemouse

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcgP82348 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgcgP82348 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgcgP82348 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgcgP82348 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgcgP82348 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SgcgP82348 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SgcgP82348 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SgcgP82348 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgcgP82348 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcgP82348 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms