Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx1P81068 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx1P81068 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx1P81068 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx1P81068 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx1P81068 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx1P81068 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx1P81068 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx1P81068 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms