Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptprn2P80560 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms