Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ldb1P70662 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ldb1P70662 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ldb1P70662 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ldb1P70662 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ldb1P70662 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ldb1P70662 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ldb1P70662 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ldb1P70662 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ldb1P70662 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ldb1P70662 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ldb1P70662 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ldb1P70662 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ldb1P70662 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms