Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Vamp7P70280 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Vamp7P70280 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Vamp7P70280 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Vamp7P70280 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Vamp7P70280 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Vamp7P70280 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vamp7P70280 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Vamp7P70280 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Vamp7P70280 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vamp7P70280 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vamp7P70280 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vamp7P70280 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vamp7P70280 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vamp7P70280 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vamp7P70280 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vamp7P70280 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vamp7P70280 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vamp7P70280 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vamp7P70280 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vamp7P70280 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vamp7P70280 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vamp7P70280 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vamp7P70280 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vamp7P70280 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vamp7P70280 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vamp7P70280 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vamp7P70280 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Vamp7P70280 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Vamp7P70280 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Vamp7P70280 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vamp7P70280 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vamp7P70280 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Vamp7P70280 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vamp7P70280 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vamp7P70280 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vamp7P70280 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vamp7P70280 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vamp7P70280 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vamp7P70280 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vamp7P70280 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vamp7P70280 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vamp7P70280 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vamp7P70280 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vamp7P70280 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vamp7P70280 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Vamp7P70280 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vamp7P70280 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vamp7P70280 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vamp7P70280 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vamp7P70280 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vamp7P70280 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vamp7P70280 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vamp7P70280 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vamp7P70280 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vamp7P70280 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vamp7P70280 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vamp7P70280 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vamp7P70280 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vamp7P70280 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vamp7P70280 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vamp7P70280 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Vamp7P70280 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vamp7P70280 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vamp7P70280 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vamp7P70280 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vamp7P70280 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vamp7P70280 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Vamp7P70280 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vamp7P70280 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vamp7P70280 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vamp7P70280 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vamp7P70280 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vamp7P70280 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vamp7P70280 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vamp7P70280 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vamp7P70280 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vamp7P70280 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vamp7P70280 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vamp7P70280 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vamp7P70280 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vamp7P70280 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vamp7P70280 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vamp7P70280 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vamp7P70280 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vamp7P70280 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vamp7P70280 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vamp7P70280 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vamp7P70280 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms