Protein–RNA interactions for Protein: P70279

Surf6, Surfeit locus protein 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf6P70279 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Surf6P70279 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Surf6P70279 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Surf6P70279 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Surf6P70279 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Surf6P70279 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms