Protein–RNA interactions for Protein: P68500

Cntn5, Contactin-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn5P68500 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntn5P68500 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cntn5P68500 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cntn5P68500 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cntn5P68500 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cntn5P68500 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cntn5P68500 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntn5P68500 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntn5P68500 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntn5P68500 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntn5P68500 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntn5P68500 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntn5P68500 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntn5P68500 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntn5P68500 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntn5P68500 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntn5P68500 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntn5P68500 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntn5P68500 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntn5P68500 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntn5P68500 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntn5P68500 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntn5P68500 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntn5P68500 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntn5P68500 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntn5P68500 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntn5P68500 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn5P68500 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn5P68500 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn5P68500 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn5P68500 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn5P68500 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn5P68500 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn5P68500 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn5P68500 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn5P68500 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn5P68500 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn5P68500 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn5P68500 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn5P68500 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn5P68500 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn5P68500 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn5P68500 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn5P68500 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn5P68500 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn5P68500 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn5P68500 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms