Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrpd1P62315 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Snrpd1P62315 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms