Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps29P62274 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rps29P62274 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rps29P62274 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rps29P62274 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rps29P62274 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rps29P62274 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rps29P62274 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rps29P62274 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms