Protein–RNA interactions for Protein: P61164

Actr1a, Alpha-centractin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actr1aP61164 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Actr1aP61164 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Actr1aP61164 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Actr1aP61164 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Actr1aP61164 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Actr1aP61164 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Actr1aP61164 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Actr1aP61164 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Actr1aP61164 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Actr1aP61164 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Actr1aP61164 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Actr1aP61164 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Actr1aP61164 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Actr1aP61164 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Actr1aP61164 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Actr1aP61164 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Actr1aP61164 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Actr1aP61164 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Actr1aP61164 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Actr1aP61164 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Actr1aP61164 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Actr1aP61164 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Actr1aP61164 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Actr1aP61164 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Actr1aP61164 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Actr1aP61164 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Actr1aP61164 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Actr1aP61164 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Actr1aP61164 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Actr1aP61164 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Actr1aP61164 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Actr1aP61164 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Actr1aP61164 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Actr1aP61164 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Actr1aP61164 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Actr1aP61164 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Actr1aP61164 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Actr1aP61164 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Actr1aP61164 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Actr1aP61164 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Actr1aP61164 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Actr1aP61164 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Actr1aP61164 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Actr1aP61164 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Actr1aP61164 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Actr1aP61164 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actr1aP61164 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actr1aP61164 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actr1aP61164 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actr1aP61164 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actr1aP61164 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actr1aP61164 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actr1aP61164 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actr1aP61164 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actr1aP61164 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actr1aP61164 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actr1aP61164 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actr1aP61164 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actr1aP61164 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actr1aP61164 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actr1aP61164 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actr1aP61164 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actr1aP61164 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actr1aP61164 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actr1aP61164 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actr1aP61164 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actr1aP61164 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actr1aP61164 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actr1aP61164 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actr1aP61164 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actr1aP61164 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actr1aP61164 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actr1aP61164 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actr1aP61164 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actr1aP61164 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actr1aP61164 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actr1aP61164 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actr1aP61164 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actr1aP61164 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actr1aP61164 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actr1aP61164 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actr1aP61164 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Actr1aP61164 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Actr1aP61164 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Actr1aP61164 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Actr1aP61164 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Actr1aP61164 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Actr1aP61164 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Actr1aP61164 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Actr1aP61164 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Actr1aP61164 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Actr1aP61164 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Actr1aP61164 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Actr1aP61164 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Actr1aP61164 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Actr1aP61164 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Actr1aP61164 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Actr1aP61164 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Actr1aP61164 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Actr1aP61164 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms