Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube2kP61087 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms