Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Snap25P60879 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Snap25P60879 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snap25P60879 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snap25P60879 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snap25P60879 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snap25P60879 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snap25P60879 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snap25P60879 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms