Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tpm2P58774 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpm2P58774 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms