Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NcstnP57716 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NcstnP57716 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NcstnP57716 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NcstnP57716 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NcstnP57716 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NcstnP57716 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NcstnP57716 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NcstnP57716 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms