Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bace1P56818 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bace1P56818 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Bace1P56818 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bace1P56818 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bace1P56818 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bace1P56818 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bace1P56818 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms