Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gp1bbP56400 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gp1bbP56400 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms