Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp5P56399 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp5P56399 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp5P56399 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp5P56399 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp5P56399 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp5P56399 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp5P56399 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp5P56399 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms