Protein–RNA interactions for Protein: P55041

Gem, GTP-binding protein GEM, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GemP55041 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GemP55041 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GemP55041 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GemP55041 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GemP55041 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GemP55041 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GemP55041 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GemP55041 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GemP55041 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GemP55041 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GemP55041 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GemP55041 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GemP55041 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GemP55041 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GemP55041 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GemP55041 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GemP55041 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GemP55041 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GemP55041 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GemP55041 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GemP55041 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GemP55041 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GemP55041 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GemP55041 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GemP55041 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GemP55041 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GemP55041 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GemP55041 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GemP55041 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GemP55041 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GemP55041 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GemP55041 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GemP55041 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GemP55041 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GemP55041 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GemP55041 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GemP55041 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GemP55041 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GemP55041 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GemP55041 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GemP55041 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GemP55041 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GemP55041 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GemP55041 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GemP55041 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GemP55041 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GemP55041 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GemP55041 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GemP55041 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GemP55041 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GemP55041 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GemP55041 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GemP55041 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GemP55041 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GemP55041 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GemP55041 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GemP55041 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GemP55041 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GemP55041 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GemP55041 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GemP55041 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GemP55041 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GemP55041 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GemP55041 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GemP55041 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GemP55041 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GemP55041 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GemP55041 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GemP55041 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GemP55041 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GemP55041 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GemP55041 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GemP55041 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GemP55041 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GemP55041 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GemP55041 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GemP55041 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GemP55041 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GemP55041 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GemP55041 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GemP55041 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GemP55041 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GemP55041 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GemP55041 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GemP55041 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GemP55041 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GemP55041 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GemP55041 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GemP55041 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GemP55041 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GemP55041 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GemP55041 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GemP55041 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GemP55041 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GemP55041 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GemP55041 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GemP55041 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GemP55041 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GemP55041 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GemP55041 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms