Protein–RNA interactions for Protein: P54846

Nrl, Neural retina-specific leucine zipper protein, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrlP54846 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NrlP54846 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NrlP54846 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NrlP54846 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NrlP54846 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NrlP54846 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NrlP54846 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NrlP54846 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NrlP54846 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NrlP54846 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NrlP54846 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NrlP54846 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NrlP54846 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NrlP54846 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NrlP54846 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NrlP54846 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NrlP54846 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NrlP54846 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NrlP54846 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NrlP54846 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NrlP54846 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NrlP54846 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NrlP54846 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NrlP54846 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NrlP54846 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NrlP54846 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NrlP54846 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NrlP54846 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NrlP54846 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NrlP54846 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NrlP54846 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NrlP54846 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NrlP54846 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NrlP54846 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NrlP54846 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NrlP54846 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NrlP54846 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NrlP54846 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NrlP54846 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NrlP54846 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NrlP54846 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NrlP54846 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NrlP54846 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NrlP54846 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NrlP54846 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NrlP54846 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NrlP54846 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NrlP54846 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NrlP54846 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NrlP54846 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NrlP54846 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NrlP54846 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NrlP54846 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NrlP54846 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NrlP54846 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NrlP54846 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NrlP54846 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NrlP54846 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NrlP54846 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NrlP54846 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NrlP54846 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NrlP54846 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NrlP54846 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NrlP54846 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NrlP54846 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NrlP54846 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NrlP54846 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NrlP54846 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NrlP54846 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NrlP54846 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NrlP54846 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NrlP54846 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NrlP54846 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NrlP54846 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NrlP54846 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NrlP54846 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NrlP54846 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NrlP54846 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NrlP54846 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NrlP54846 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NrlP54846 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NrlP54846 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NrlP54846 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NrlP54846 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NrlP54846 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NrlP54846 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NrlP54846 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NrlP54846 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NrlP54846 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NrlP54846 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NrlP54846 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NrlP54846 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NrlP54846 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NrlP54846 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NrlP54846 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NrlP54846 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NrlP54846 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NrlP54846 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NrlP54846 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NrlP54846 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms