Protein–RNA interactions for Protein: P54254

Atxn1, Ataxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn1P54254 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atxn1P54254 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atxn1P54254 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms