Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

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Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Lbx1P52955 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
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Lbx1P52955 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Lbx1P52955 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Lbx1P52955 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Lbx1P52955 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Lbx1P52955 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lbx1P52955 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms