Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Upp1P52624 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Upp1P52624 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upp1P52624 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Upp1P52624 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Upp1P52624 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upp1P52624 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upp1P52624 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upp1P52624 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upp1P52624 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Upp1P52624 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Upp1P52624 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Upp1P52624 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upp1P52624 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upp1P52624 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms