Protein–RNA interactions for Protein: P51944

Ccnf, Cyclin-F, mousemouse

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Length 777 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnfP51944 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CcnfP51944 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CcnfP51944 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CcnfP51944 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CcnfP51944 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CcnfP51944 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CcnfP51944 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CcnfP51944 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CcnfP51944 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CcnfP51944 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CcnfP51944 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CcnfP51944 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CcnfP51944 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CcnfP51944 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CcnfP51944 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CcnfP51944 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CcnfP51944 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CcnfP51944 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CcnfP51944 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CcnfP51944 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CcnfP51944 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CcnfP51944 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CcnfP51944 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CcnfP51944 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CcnfP51944 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CcnfP51944 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CcnfP51944 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CcnfP51944 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CcnfP51944 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CcnfP51944 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CcnfP51944 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CcnfP51944 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CcnfP51944 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CcnfP51944 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CcnfP51944 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CcnfP51944 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CcnfP51944 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CcnfP51944 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CcnfP51944 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CcnfP51944 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CcnfP51944 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CcnfP51944 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CcnfP51944 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CcnfP51944 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CcnfP51944 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CcnfP51944 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CcnfP51944 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CcnfP51944 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CcnfP51944 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CcnfP51944 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
CcnfP51944 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CcnfP51944 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CcnfP51944 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CcnfP51944 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CcnfP51944 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CcnfP51944 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CcnfP51944 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CcnfP51944 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CcnfP51944 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CcnfP51944 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CcnfP51944 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CcnfP51944 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CcnfP51944 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CcnfP51944 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CcnfP51944 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CcnfP51944 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CcnfP51944 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CcnfP51944 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CcnfP51944 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CcnfP51944 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CcnfP51944 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CcnfP51944 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CcnfP51944 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CcnfP51944 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CcnfP51944 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CcnfP51944 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CcnfP51944 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CcnfP51944 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CcnfP51944 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CcnfP51944 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CcnfP51944 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CcnfP51944 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CcnfP51944 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CcnfP51944 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CcnfP51944 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CcnfP51944 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CcnfP51944 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CcnfP51944 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CcnfP51944 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CcnfP51944 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CcnfP51944 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CcnfP51944 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CcnfP51944 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CcnfP51944 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CcnfP51944 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CcnfP51944 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CcnfP51944 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CcnfP51944 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CcnfP51944 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CcnfP51944 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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