Protein–RNA interactions for Protein: P51682

Ccr5, C-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr5P51682 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccr5P51682 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccr5P51682 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms