Protein–RNA interactions for Protein: P51180

Mip, Lens fiber major intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MipP51180 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MipP51180 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MipP51180 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MipP51180 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MipP51180 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MipP51180 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MipP51180 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MipP51180 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MipP51180 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MipP51180 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MipP51180 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MipP51180 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MipP51180 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MipP51180 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MipP51180 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MipP51180 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MipP51180 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MipP51180 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MipP51180 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MipP51180 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MipP51180 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MipP51180 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MipP51180 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MipP51180 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MipP51180 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MipP51180 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MipP51180 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MipP51180 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MipP51180 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MipP51180 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MipP51180 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MipP51180 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MipP51180 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MipP51180 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MipP51180 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MipP51180 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MipP51180 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MipP51180 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MipP51180 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MipP51180 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MipP51180 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MipP51180 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MipP51180 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MipP51180 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MipP51180 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MipP51180 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MipP51180 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MipP51180 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MipP51180 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MipP51180 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MipP51180 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MipP51180 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MipP51180 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MipP51180 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MipP51180 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MipP51180 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MipP51180 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MipP51180 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MipP51180 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MipP51180 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MipP51180 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MipP51180 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MipP51180 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MipP51180 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MipP51180 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MipP51180 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MipP51180 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MipP51180 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MipP51180 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MipP51180 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MipP51180 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MipP51180 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MipP51180 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MipP51180 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MipP51180 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MipP51180 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MipP51180 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MipP51180 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MipP51180 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MipP51180 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MipP51180 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MipP51180 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MipP51180 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MipP51180 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MipP51180 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MipP51180 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MipP51180 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MipP51180 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MipP51180 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MipP51180 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MipP51180 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MipP51180 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MipP51180 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MipP51180 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MipP51180 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MipP51180 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MipP51180 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MipP51180 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MipP51180 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MipP51180 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms