Protein–RNA interactions for Protein: P50716

Defa-rs12, Alpha-defensin-related sequence 12, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs12P50716 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Defa-rs12P50716 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Defa-rs12P50716 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Defa-rs12P50716 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Defa-rs12P50716 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Defa-rs12P50716 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa-rs12P50716 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa-rs12P50716 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa-rs12P50716 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa-rs12P50716 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa-rs12P50716 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa-rs12P50716 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa-rs12P50716 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa-rs12P50716 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa-rs12P50716 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa-rs12P50716 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa-rs12P50716 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa-rs12P50716 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa-rs12P50716 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa-rs12P50716 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa-rs12P50716 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa-rs12P50716 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa-rs12P50716 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa-rs12P50716 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa-rs12P50716 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa-rs12P50716 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa-rs12P50716 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa-rs12P50716 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa-rs12P50716 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa-rs12P50716 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa-rs12P50716 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa-rs12P50716 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa-rs12P50716 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa-rs12P50716 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa-rs12P50716 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa-rs12P50716 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa-rs12P50716 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa-rs12P50716 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa-rs12P50716 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa-rs12P50716 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa-rs12P50716 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa-rs12P50716 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa-rs12P50716 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa-rs12P50716 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa-rs12P50716 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa-rs12P50716 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa-rs12P50716 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa-rs12P50716 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa-rs12P50716 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa-rs12P50716 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa-rs12P50716 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa-rs12P50716 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa-rs12P50716 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa-rs12P50716 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa-rs12P50716 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa-rs12P50716 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa-rs12P50716 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa-rs12P50716 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa-rs12P50716 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa-rs12P50716 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa-rs12P50716 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms