Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa8P50706 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa8P50706 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa8P50706 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa8P50706 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Defa8P50706 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa8P50706 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa8P50706 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa8P50706 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa8P50706 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa8P50706 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Defa8P50706 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Defa8P50706 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Defa8P50706 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Defa8P50706 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Defa8P50706 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Defa8P50706 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Defa8P50706 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Defa8P50706 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa8P50706 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa8P50706 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa8P50706 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa8P50706 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa8P50706 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa8P50706 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Defa8P50706 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa8P50706 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Defa8P50706 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Defa8P50706 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Defa8P50706 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Defa8P50706 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Defa8P50706 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa8P50706 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa8P50706 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Defa8P50706 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa8P50706 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Defa8P50706 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms