Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SftpdP50404 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SftpdP50404 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms