Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epb42P49222 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epb42P49222 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epb42P49222 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Epb42P49222 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epb42P49222 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epb42P49222 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epb42P49222 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms