Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnni3P48787 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms