Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms