Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Epb41P48193 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Epb41P48193 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Epb41P48193 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Epb41P48193 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Epb41P48193 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Epb41P48193 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Epb41P48193 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Epb41P48193 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Epb41P48193 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Epb41P48193 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Epb41P48193 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Epb41P48193 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Epb41P48193 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Epb41P48193 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Epb41P48193 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Epb41P48193 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Epb41P48193 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Epb41P48193 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Epb41P48193 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Epb41P48193 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Epb41P48193 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Epb41P48193 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Epb41P48193 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Epb41P48193 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Epb41P48193 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Epb41P48193 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Epb41P48193 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Epb41P48193 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Epb41P48193 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Epb41P48193 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Epb41P48193 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Epb41P48193 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Epb41P48193 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Epb41P48193 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Epb41P48193 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Epb41P48193 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Epb41P48193 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Epb41P48193 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Epb41P48193 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Epb41P48193 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Epb41P48193 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Epb41P48193 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Epb41P48193 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Epb41P48193 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Epb41P48193 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Epb41P48193 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Epb41P48193 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Epb41P48193 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Epb41P48193 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms