Protein–RNA interactions for Protein: P47867

Scg3, Secretogranin-3, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg3P47867 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg3P47867 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scg3P47867 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scg3P47867 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scg3P47867 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scg3P47867 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scg3P47867 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scg3P47867 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scg3P47867 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms