Protein–RNA interactions for Protein: P46660

Ina, Alpha-internexin, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InaP46660 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
InaP46660 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
InaP46660 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
InaP46660 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
InaP46660 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
InaP46660 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
InaP46660 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
InaP46660 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
InaP46660 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
InaP46660 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
InaP46660 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
InaP46660 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
InaP46660 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
InaP46660 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
InaP46660 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
InaP46660 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
InaP46660 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
InaP46660 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
InaP46660 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
InaP46660 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
InaP46660 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
InaP46660 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
InaP46660 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
InaP46660 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
InaP46660 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
InaP46660 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
InaP46660 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
InaP46660 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
InaP46660 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
InaP46660 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
InaP46660 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
InaP46660 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
InaP46660 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
InaP46660 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
InaP46660 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
InaP46660 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
InaP46660 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
InaP46660 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
InaP46660 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
InaP46660 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
InaP46660 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
InaP46660 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
InaP46660 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
InaP46660 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
InaP46660 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
InaP46660 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
InaP46660 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
InaP46660 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
InaP46660 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
InaP46660 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
InaP46660 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
InaP46660 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
InaP46660 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
InaP46660 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
InaP46660 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
InaP46660 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
InaP46660 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
InaP46660 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
InaP46660 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
InaP46660 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
InaP46660 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
InaP46660 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
InaP46660 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
InaP46660 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
InaP46660 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
InaP46660 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
InaP46660 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
InaP46660 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
InaP46660 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
InaP46660 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
InaP46660 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
InaP46660 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
InaP46660 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
InaP46660 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
InaP46660 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
InaP46660 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
InaP46660 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
InaP46660 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
InaP46660 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
InaP46660 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
InaP46660 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
InaP46660 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
InaP46660 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
InaP46660 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
InaP46660 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
InaP46660 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
InaP46660 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
InaP46660 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
InaP46660 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
InaP46660 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
InaP46660 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
InaP46660 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
InaP46660 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
InaP46660 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
InaP46660 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
InaP46660 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
InaP46660 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
InaP46660 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
InaP46660 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
InaP46660 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms